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Eduardo Martini nasceu em 11 de janeiro de 1979, na cidade de Feliz, Rio Grande do Sul. Iniciou sua carreira no futebol nas categorias de base do Grêmio Foot-Ball Porto Alegrense.
Após se destacar na base do Grêmio, Martini foi contratado pela Associação Atlética Ponte Preta em 2002. No clube campineiro, atuou por quatro temporadas, conquistando o Campeonato Paulista Série A2 em 2003.
Em 2006, transferiu-se para o Sport Club do Recife, onde permaneceu por duas temporadas. Posteriormente, defendeu as cores do Grêmio Barueri Futebol, do São Caetano Futebol e do Clube Atlético Bragantino.
Martini foi convocado para a Seleção Brasileira Sub-20 em 1999, disputando o Campeonato Mundial da categoria.
Eduardo Martini encerrou sua carreira profissional em 2015, após defender o Clube Atlético Bragantino.